合同工受工伤在职期间的处理可能因特殊情况发生变化，以下是具体例外情形及影响。
1. 用人单位未参加工伤保险：若单位未为合同工缴纳工伤保险，停工留薪期工资、医疗费用等所有工伤待遇均由单位自行承担，且单位可能拒绝支付，需通过劳动仲裁或诉讼维权，处理周期更长。
2. 工伤与自身疾病混合：若工伤导致原有疾病加重（如原有腰椎间盘突出因工伤恶化），需经劳动能力鉴定委员会确认加重部分与工伤的关联性，若无法确认，则仅针对工伤直接导致的伤情计算停工留薪期，康复时间可能缩短。
3. 停工留薪期满后仍需治疗：若合同工在停工留薪期满后仍无法工作且需继续治疗，可继续享受工伤医疗待遇，但不再享受停工留薪期工资，需按病假或伤残津贴处理，收入可能减少。
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合同工受工伤在职期间的核心是停工留薪期的确定，这直接关系到工伤待遇的享受时长。
工伤停职留薪时间根据医疗机构的诊断证明和劳动能力鉴定结果确定。
1. 若存在医疗机构出具的短期治疗诊断证明（如3个月内康复）：停工留薪期以该诊断证明载明的时间为准，期间原工资福利待遇不变，由单位按月支付。
2. 若伤情严重或情况特殊（如骨折需长期康复）：需经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可适当延长停工留薪期，但延长不得超过12个月，总时长不超过24个月。
3. 若已评定伤残等级：停发停工留薪期待遇，开始享受伤残待遇（如一次性伤残补助金、伤残津贴等）。
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合同工受工伤在职期间的停工留薪期规定有明确的法律依据，具体适用《工伤保险条例》的相关条款。
根据《工伤保险条例》（2010年修订版）第三十三条规定：“职工因工作遭受事故伤害或者患职业病需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。工伤职工评定伤残等级后，停发原待遇，按照本章的有关规定享受伤残待遇。” 合同工属于该条例调整的“职工”范畴，其停工留薪期需先以医疗机构诊断证明为准，超出12个月的需经劳动能力鉴定委员会确认，评定伤残后则切换至伤残待遇，因此停工留薪期的确定需严格遵循该条款的双重依据（诊断证明+鉴定结果）。
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合同工受工伤在职期间可能面临潜在法律风险，以下是具体风险点及实例。
1. 诉讼时效风险：若合同工因疏忽未在事故伤害发生之日起1年内申请工伤认定，将丧失工伤待遇的申请资格。例如：某合同工2023年5月受伤，2024年6月才申请工伤认定，社会保险行政部门将以超过时效为由不予受理，其停工留薪期工资和伤残待遇均无法享受。
2. 证据链断裂风险：若未留存完整的医疗诊断证明或劳动能力鉴定结论，单位可能否认停工留薪期的合理性。例如：某合同工仅持有手写的门诊记录，无医院盖章的康复诊断证明，单位仅按3个月支付停工留薪期工资，而实际需6个月康复的费用需自行承担。

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